Las investigaciones que realiza el ISEI-IVEI surgen de tres fuentes principales:
• El análisis en profundidad de algún aspecto significativo y problemático que haya aparecido en las distintas evaluaciones autonómicas, nacionales e internacionales que afectan al sistema educativo vasco,
• El encargo del Departamento de Educación relativos a aspectos relevantes para mejorar el sistema o algún proceso o proyecto concreto de afecta a algún estamento educativo
• El derivado de logros relacionado con objetivos educativos europeos que es necesario implementar.
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